新书推介:《语义网技术体系》
作者:瞿裕忠,胡伟,程龚
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       本主题类别: 数据挖掘    
     DMman 帅哥哟,离线,有人找我吗?魔羯座1984-1-11
      
      
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    发贴心情 matlab的数据挖掘工具箱spider

    一 spider主页http://www.kyb.mpg.de/bs/people/spider/ (也可以在google上搜索spider matlab得到),关于它的介绍可以参考网址资料

    二 使用时为matlab+spider+Weka;因为spider中的一些算法引用了Weka,比如j48

    安装注意:

    1 matlab7(R14)

      6.5版本对java的支持不够,还没有开发javaclasspath等函数

    ??? Undefined function or variable 'javaclasspath'.
    ??? Undefined function or variable 'javaaddclasspath'.

    2 jre1.4.2

    matlab7自带的是1.4.2;matlab6自带的是1.3.可以在D:\MATLAB7\sys\java\jre\win32下看到。如果装了matlab7,使用它自带的1.4.2就可以了,尤其不要使用1.6,因为1.6太新了,matlab还不支持。可以在Matlab下使用 version -java查看JVM版本。

    如果你想使用1.5的话,C:\Program Files\Java\jre1.5.0_10;把jre1.5.0_10这个文件夹拷贝到D:\MATLAB7\sys\java\jre\win32下,然后增加环境变量MATLAB_JAVA:D:\MATLAB7\sys\java\jre\win32\jre1.5.0_10。这一步如果有问题的话,重启Matlab会给出错误提示。找不到什么什么文件...

    3 Weka3.4.10

      使用weka版本低一些即可,高的不行,因为高版本的weka可能是用高版本的jvm支持的。

    我使用的组合是 matlab7(R14)+jre1.4.2(matlab7自带的,不需要任何设置)+Weka3.4.10

    三 使用方法

    1 下载spider,有core和extra两个压缩包,把他们解压到同一个文件夹spider下面,然后放到$matlabroot\toolbox下面

    2下载weka3.4.10,找到weka.jar放到$matlabroot\java\jar下面

    3 启动Matlab打开$matlabroot\toolbox\spider\use_spider.m运行

    提示spider的一些信息和 WEKA support enabled!表示成功了。

    然后可以使用 help spider命令查看信息,他的功能列出如附录,然后就可以训练了。

    四 一个简单的例子

    X=rand(50)-0.5; Y=sign(sum(X,2));
    dtrain=data(X,Y);
    %生成训练集,也可以使用load()从文件读取

    model=train(svm,dtrain));
    %使用函数train()训练模型

    rtest=test(dtest,model);
    %使用训练好的模型对验证集dtest测试,返回测试结果

    五 附录spider信息

    最新spider Version 1.71 (24/7/2006)

    Basic library objects.
        data         - Storing input data and output results
        data_global  - Implementation of data object that limits memory overhead
        algorithm    - Generic algorithm object
        group        - Groups sets of objects together (algorithms or data)
        loss         - Evaluates loss functions
        get_mean     - Takes mean loss over groups of algs
        chain        - Builds chains of objects: output of one to input of another
        param        - To train and test different hyperparameters of an object
        cv           - Cross validation using objects given data
        kernel       - Evaluates and caches kernel functions
        distance     - Evaluates and caches distance functions

      Statistical Tests objects.
        wilcoxon     - Wilcoxon test of statistical significance of results
        corrt_test   - Corrected resampled t-test - for dependent trials

      Dataset objects.
        spiral       - Spiral dataset generator.
        toy          - Generator of dataset with only a few relevant features
        toy2d        - Simple 2d Gaussian problem generator
        toyreg       - Linear Regression with o outputs and n inputs

      Pre-Processing objects
        normalize    - Simple normalization of data
        map          - General user specified mapping function of data

      Density Estimation objects.
        parzen       - Parzen's windows kernel density estimator
        indep        - Density estimator which assumes feature independence
        bayes        - Classifer based on density estimation for each class
        gauss        - Normal distribution density estimator
                         
      Pattern Recognition objects.
        svm          - Support Vector Machine (svm)
        c45          - C4.5 for binary or multi-class
        knn          - k-nearest neighbours
        platt        - Conditional Probability estimation for margin classifiers
        mksvm        - Multi-Kernel LP-SVM
        anorm        - Minimize the a-norm in alpha space using kernels
        lgcz         - Local and Global Consistent Learner
        bagging      - Bagging Classifier
        adaboost     - ADABoost method
        hmm          - Hidden Markov Model
        loom         - Leave One Out Machine
        l1           - Minimize l1 norm of w for a linear separator
        kde          - Kernel Dependency Estimation: general input/output machine
        dualperceptron       - Kernel Perceptron
        ord_reg_perceptron   - Ordinal Regression Perceptron (Shen et al.)
        splitting_perceptron - Splitting Perceptron (Shen et al.)
        budget_perceptron    - Sparse, online Pereceptron (Crammer et al.)
        randomforest - Random Forest Decision Trees         WEKA-Required
        j48          - J48 Decision Trees for binary        WEKA-Required

      Multi-Class and Multi-label objects.
        one_vs_rest  - Voting method of one against the rest (also for multi-label)
        one_vs_one   - Voting method of one against one
        mc_svm       - Multi-class Support Vector Machine by J.Weston
        c45          - C4.5 for binary or multi-class
        knn          - k-nearest neighbours
                    
      Feature Selection objects.
        feat_sel     - Generic object for feature selection + classifier
        r2w2_sel     - SVM Bound-based feature selection
        rfe          - Recursive Feature Elimination (also for the non-linear case)
        l0           - Dual zero-norm minimization (Weston, Elisseeff)
        fsv          - Primal zero-norm based feature selection (Mangasarian)
        fisher       - Fisher criterion feature selection
        mars         - selection algorithm of Friedman (greedy selection)
        clustub      - Multi-class feature selection using spectral clustering
        mutinf       - Mutual Information for feature selection.
           
      Regression objects.
        svr          - Support Vector Regression
        gproc        - Gaussian Process Regression
        relvm_r      - Relevance vector machine
        multi_rr     - (possibly multi-dimensional) ridge regression   
        mrs          - Multivariate Regression via Stiefel Constraints      
        knn          - k-nearest neighbours
        multi_reg    - meta method for independent multiple output regression
        kmp          - kernel matching pursuit
        kpls         - kernel partial least squares
        lms          - least mean squared regression [now obselete due to multi_rr]
        rbfnet       - Radial Basis Function Network (with moving centers)
        reptree      - Reduced Error Pruning Tree       WEKA-Required

      Model Selection objects.
        gridsel      - select parameters from a grid of values
        r2w2_sel     - Selecting SVM parameters by generalization bound
        bayessel     - Bayessian parameter selection

      Unsupervised objects.
        one_class_svm - One class SVM
        kmeans       - K means clustering
        kvq          - Kernel Vector Quantization
        kpca         - Kernel Principal Components Analysis
        ppca         - Probabilistic Principal Component Analysis
        nmf          - Non-negative Matrix factorization
        spectral     - Spectral clustering
        mrank        - Manifold ranking
        ppca         - Probabilistic PCA

      Reduced Set and Pre-Image objects.
        pmg_mds      - Calculate Pre-Images based on multi-dimensional scaling
        pmg_rr       - Calculate Pre-Images based on learning and ridge regression
        rsc_burges   - Bottom Up Reduced Set; calculates reduced set based on gradient descent
        rsc_fp       - Bottom Up Reduced Set; calculates reduced set for rbf with fixed-point iteration schemes
        rsc_mds      - Top Down Reduced Set; calculates reduced set with multi-dimensional scaling
        rsc_learn    - Top Down Reduced Set; calculates reduced set with ridge regression
        rss_l1       - Reduced Set Selection via L1 penalization
        rss_l0       - Reduced Set Selection via L0 penalization
        rss_mp       - Reduced Set Selection via matching pursuit


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